ประเด็น ไม่รับรองรายชื่อผู้สมัคร จากทางสมาคมฟุตบอลแห่งประเทศไทย กำลังกลายเป็นการตีความ ว่าด้วยความชอบธรรม ต่อการที่สมาคมประกาศไม่รับรอง เพราะหมายถึง การตัดสิทธิผู้สมัคร ทั้งในรายของ พลตำรวจเอกสมยศ พุ่มพันธ์ม่วง อดีตผู้บัญชาการตำรวจแห่งชาติ พร้อมทีมงาน รวมทั้งในรายของ ณัฐพล ทีปสุวรรณ ประธานสโมสรบางกอกเอฟซี จากดิวิชั่น 1 ที่ร่วมลงสมัครในครั้งนี้ จากผู้สมัครทั้งหมด 6 ราย ด้วยมูลเหตุที่ไม่ไปสมัครกับ ทางสมาคมฟุตบอล
แม้ว่าสหพันธ์ฟุตบอลนานาชาติหรือฟีฟ่า จะมอบอำนาจให้คณะกรรมการกลาง ที่มีพลเรือเอกสุรวุฒิ มหารมณ์ ทำหน้าที่ประธาน และมอบงานในการเข้ามาจัดการเลือกตั้ง นับตั้งแต่เดือนตุลาคม ที่ผ่านมา แต่ในการทำงาน ก็ต้องเผชิญกับแรงกดดันรอบด้าน รวมทั้งกรณีล่าสุด การอ้างสิทธิในฐานะนายทะเบียน ที่จะเป็นผู้รับรองรายชื่อ บุคคลที่มาสมัครกับทางสมาคมฟุตบอลโดยตรง ขณะที่คณะทำงานกลาง ก็อ้างถึงความชอบธรรมในการดำเนินการในเรื่องนี้ การตีความไปกันคนละด้านในมุ่มของแต่ละฝ่าย ล้วนแต่เป็นการบ่งชี้ ให้เห็นถึงความวุ่นวาย ที่ไม่สามารถยุติลงได้โดยง่าย
ส่วนประเด็นล่าสุด ที่ต้องจับตา ก็คือ การร้องต่อศาลปกครอง จากตัวแทนทีมฟุตบอลในลีกทางภาคใต้ ด้วยการขอให้ศาลมีคำสั่งระงับการเลือกตั้ง 30 เสียง จาก 83 ทีม ที่ จะมีขึ้นในวันพรุ่งนี้ ที่การกีฬาแห่งประเทศไทย อ้างถึงความไม่ชอบธรรม ก็ล้วนแต่เป็นปัญหาที่ก่อตัวขึ้น ไม่นับรวมกับปัญหา การจัดทีมฟุตบอลไทยลีก ฤดูกาล 2016 ว่า ควรจะมี 18 หรือ 20 ทีม การฟ้องร้องต่อศาล ของทีมฟุตบอลในไทยพรีเมียร์ลีก ทั้งคู่ของ บีอีซีเทโร กับแบงค็อกยูไนเต็ด และทีมในดิวิชั่น 1 คู่ของ สุโขทัย เอฟซี กับนครปฐม ยูไนเต็ด ปัญหาเหล่านี้ ล้วนแต่เป็นเงื่อนไข แห่งความวุ่นวาย ที่จะทำให้ฟุตบอลไทย เสี่ยง ต่อการที่จะถูกลงโทษ และที่น่าเป็นห่วงมากที่สุด คือการเข้าสู่เงื่อนไข ให้ฟีฟ่าใช้อำนาจตัดสิทธิห้ามเข้าแข่งขันในรายการต่างๆ ทั้ง ฟุตบอลในนามทีมชาติ และทีมระดับสโมสร หลังจากประเมินแแล้วว่าฟุตบอลไทย อยู่ในภาวะที่ไร้การควบคุม