เส้นทางภาคใต้ เปิดให้บริการ 18 เส้นทาง 43 เที่ยววิ่งต่อวัน ได้แก่ 1.กรุงเทพฯ – ปัตตานี – ยะลา 2.กรุงเทพฯ – สุไหงโกลก 3.กรุงเทพฯ – สงขลา 4.กรุงเทพฯ – ภูเก็ต 5.กรุงเทพฯ – คลองท่อม – กระบี่ 6.กรุงเทพฯ – ดอนสัก – เกาะสมุย 7.กรุงเทพฯ – ด่านเจดีย์สามองค์ 8.กรุงเทพฯ (หมอชิต 2) – หาดใหญ่ 9.กรุงเทพฯ (หมอชิต 2) – ภูเก็ต 10.กรุงเทพฯ (หมอชิต 2) – ปัตตานี 11.กรุงเทพฯ (หมอชิต 2) – สตูล 12.กรุงเทพฯ (หมอชิต 2) – ตะกั่วป่า – โคกกลอย 13.กรุงเทพฯ (หมอชิต 2) – เกาะสมุย 14.กรุงเทพฯ (หมอชิต 2) – ตรัง – สตูล 15.กรุงเทพฯ (หมอชิต 2) – เกาะพะงัน 16.กรุงเทพฯ (หมอชิต 2) – นครศรีธรรมราช – หัวไทร และ 17.กรุงเทพฯ (หมอชิต 2) – กระบี่ และ18.กรุงเทพฯ (หมอชิต 2) – ตรัง
นอกจากนี้ปัจจุบัน บขส. ได้ให้บริการเดินรถเส้นทางระหว่างประเทศ ไทย – สปป.ลาว จำนวน 9 เส้นทาง 92 เที่ยววิ่งต่อวัน มีผู้โดยสารใช้บริการทั้งสองฝั่ง จำนวน 3,000 คนต่อวัน ดังนี้ 1.เส้นทางหนองคาย – นครหลวงเวียงจันทน์ 2.อุดรธานี – นครหลวงเวียงจันทน์ 3.นครพนม – เมืองท่าแขก 4.อุบลราชธานี – เมืองปากเซ 5.กรุงเทพฯ – เมืองปากเซ 6.มุกดาหาร – แขวงสะหวันนะเขต 7.กรุงเทพฯ – นครหลวงเวียงจันทน์ 8.เลย – แขวงไซยบุรี – แขวงหลวงพระบาง และ 9.เชียงราย – แขวงบ่อแก้ว
ทั้งนี้ผู้โดยสารสามารถจองตั๋วได้ทุกช่องทางของ บขส. อาทิ ช่องทางออนไลน์ Facebook Page : บขส. (www.facebook.com/BorKorSor99), Line : @บขส.99 (Id : TCL99), เว็บไซต์ บขส. https://tcl99web.transport.co.th, Application E – ticket และ ช่องจำหน่ายตั๋วโดยสาร บขส. ทั่วประเทศ สอบถามข้อมูลเพิ่มเติมได้ที่เบอร์โทร. 0 – 2936 – 3660 ในวันและเวลาราชการ