กระทรวงต่างประเทศเอสโตเนียตัดสินใจไม่ให้เรือลำนี้เข้ามาในน่านน้ำเมื่อวันพุธ โดยบอกว่าเอสโตเนียไม่ยอมรับการผนวกดินแดนไครเมียอย่างผิดกฏหมาย และการอนุญาตให้เรือเซียดอฟเข้ามาในน่านน้ำเอสโตเนีย ก็จะขัดแย้งกับนโยบายไม่ยอมรับดังกล่าว และเมื่อวันศุกร์ โปแลนด์ก็ดำเนินการอย่างเดียวกัน ด้วยเหตุผลเดียวกัน โดยระบุด้วยว่าเป็นการตัดสินใจของนายกรัฐมนตรีมาเตอุซ โมราเวียสกี้
หลังจากเอสโตเนียออกมาห้ามเรือเข้าน่านน้ำ มีรายงานว่าเรือมุ่งหน้าไปยังโปแลนด์ แต่ก็ถูกโปแลนด์ห้ามเข้าอีก ขณะที่กระทรวงต่างประเทศรัสเซียบอกว่าท่าทีเหล่านี้ไม่เป็นมิตร และยั่วยุ
ปัญหาเรื่องนี้เกิดขึ้นในช่วงที่อีกไม่กี่วันนี้ ผู้นำเอสโตเนียจะเดินทางไปเยือนรัสเซียเพื่อเปิดสถานทูตที่ถูกปรับปรุงใหม่ และพบกับผู้นำรัสเซีย
ความสัมพันธ์ระหว่างเอสโตเนียกับรัสเซียนั้นไม่ดีนัก หลังเอสโตเนียออกจากสหภาพโซเวียตในปี 2534 ก่อนจะไปเข้าร่วมกับสหภาพยุโรปและกลุ่มนาโต้