โมฮัมเหม็ดเป็นหนึ่งในผู้ช่วยที่ โอซามา บิน ลาเดน ผู้นำเครือข่ายก่อการร้ายอัลไกดา ไว้ใจที่สุด เขาถูกระบุว่า เป็นผู้วางแผนก่อวินาศกรรมสะเทือนโลก ที่ทำให้มีผู้เสียชีวิตมากถึง 2,976 ราย สลัดอากาศลงมือยึดเครื่องบินโดยสาร 4 ลำ โดยแต่ละลำพุ่งชนตึกแฝดเวิลด์เทรด เซ็นเตอร์ ในนครนิวยอร์ก, อาคารกระทรวงกลาโหมนอกกรุงวอชิงตัน และลำที่ 4 ตกลงในทุ่งในรัฐเพนซิลเวเนีย หลังผู้โดยสารพยายามต่อสู้กับสลัดอากาศ
สภาความมั่นคงแห่งชาติ ชี้แจงว่า ทำเนียบขาวได้รับทราบเรื่องข้อตกลงรับสารภาพของโมฮัมเหม็ดและพวกอีก 2 คนในวันพุธ และไม่มีส่วนเกี่ยวข้องกับการเจรจา
แต่บางครอบครัวของผู้เสียชีวิตแสดงความผิดหวังกับข้อตกลง เพราะอยากเห็นผู้ต้องหาได้รับโทษสูงสุด และพรรครีพับลิกันรีบออกมาโจมตีรัฐบาลที่ยอมทำข้อตกลงกับผู้ต้องหา