มีประวัติการรับราชการตามลำดับ ดังนี้
พ.ศ.2519 - พ.ศ.2544 อาจารย์ประจำคณะนิติศาสตร์ มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์
พ.ศ.2544 - พ.ศ.2548 อธิบดีศาลปกครองกลาง
พ.ศ.2549 - พ.ศ.2553 ตุลาการศาลปกครองสูงสุด
พ.ศ.2553 - พ.ศ.2558 ตุลาการหัวหน้าคณะศาลปกครองสูงสุด
พ.ศ.2558 - พ.ศ.2559 ตุลาการหัวหน้าแผนกคดีบริหารงานบุคคลในศาลปกครองสูงสุด
พ.ศ.2559 - ปัจจุบัน รองประธานศาลปกครองสูงสุด
และปัจจุบันมีตำแหน่งทางวิชาการ ศาสตราจารย์พิเศษ สาขาวิชากฎหมายมหาชน คณะนิติศาสตร์ มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์
ทั้งนี้ นายวรพจน์ ได้รับพระราชทานเครื่องราชอิสริยาภรณ์ชั้นสูงสุดมหาปรมาภรณ์ช้างเผือก และยังได้รับเครื่องราชอิสริยาภรณ์ต่างประเทศ l’Ordre national du Mérite ชั้น Chevalier จากสาธารณรัฐฝรั่งเศสด้วย