แม้หลายฝ่ายจะปฏิเสธว่าการตัดสิทธิ์ GSP ซึ่งเป็นมาตรการทางภาษีที่สหรัฐผ่อนปรนให้กับประเทศไทยมาอย่างยาวนานกับสินค้าบางประเภท จะไม่เกี่ยวข้องกับการแบนสารเคมีเกษตร 3 ชนิด ของคณะกรรมการวัตถุอันตราย ก่อนหน้านี้
แต่ผู้เกี่ยวข้องที่เป็นคู่กรณีกัน เช่นมูลนิธิชีววิถี หรือไบโอไทย และ กลุ่มคนรักแม่กลอง ก็พูดในเรื่องเดียวกัน คือการแบนสารเคมีการเกษตร จะกระทบการนำเข้าถั่วเหลือง ดัดแปลงพันธุกรรม หรือ GMO เข้ามาในประเทศไทย ซึ่งผู้ส่งออกก็คือสหรัฐอเมริกา ยิ่งตอกย้ำให้เห็นภาพว่าอเมริกานั้น เสียดุลการค้าไทยมากไปอีก จากตัวเลขปัจจุบันที่เสียดุลการค้าให้ไทยอยู่แล้วถึง 20,000 ล้านบาท
หลายคนอาจงงว่าแล้วพืช GMO เกี่ยวอะไรกับการแบนสารเคมี? ก็จะขออธิบายให้เข้าใจง่ายๆว่า ถ้าเป็นพืช Original ทั่วไปไม่มีการดัดแปลงพันธุกรรม เมื่อเจอสารเคมีก็จะเหี่ยวเฉาตายไป แต่ถ้าหากเป็นพืชที่ดัดแปลงพันธุกรรมอาจทนต่อสารเคมีได้ เช่นเดียวกับที่มีการ ดัดแปลงพันธุกรรมพืช ให้ทนต่อความแห้งแล้ง
ซึ่งหลังการแบน 3 สารเคมีของรัฐบาลไทย สหรัฐอเมริกาจะไม่สามารถส่งออก ถั่วเหลืองและข้าวสาลี ที่ใช้ไกลโฟเสทได้ เพราะผิดสัญญา WTO ที่ระบุว่า "หากประเทศใดมีการแบนสารเคมี.ผลผลิตที่ใช้สารเคมีนั้น ก็จะถูกก็แบนไปด้วย จะไม่สามารถนำเข้าได้" ทั้งนี้ประเทศไทยนำเข้าถั่วเหลืองเกือบร้อยเปอร์เซ็นต์มาทำนมถั่วเหลืองและอาหารสัตว์