ทั้งนี้ เมื่อวันที่ 2ก.ย.2558 กระทรวงการต่างประเทศ ได้ดำเนินการยกเลิกหนังสือเดินทางหรือพาสปอร์ตทุกเล่มของคุณจาตุรนต์ หลังจากที่สำนักงานตำรวจแห่งชาติ (ส่งหนังสือเพื่อยื่นคำร้องขอให้กระทรวงการต่างประเทศดำเนินการหนังสือระบุถึงสาเหตุการยกเลิกพาสปอร์ต จากการวิพากษ์วิจารณ์การทำงานของรัฐบาล และ คสช. นอกจากนี้ คุณจาตุรนต์ เป็นผู้ต้องหาคดีขัดคำสั่ง คสช.ที่ไม่เข้ารายงานตัว ในการกระทำการยุยง ปลุกปั่นให้เกิดความไม่สงบหรือละเมิดกฎหมายแผ่นดินตามประมวลกฎหมายอาญา มาตรา 116 กรณีการร่วมปาฐกถาที่สมาคมผู้สื่อข่าวต่างประเทศ
ซึ่งกระทรวงการต่างประเทศได้ทำหนังสือเวียน แจ้งให้สถานเอกอัครราชทูต และกงสุลใหญ่ไทยได้ทราบในการยกเลิกพาสปอร์ตทุกเล่มของคุณจาตุรนต์ ด้วย