สำนักงานอวกาศรัสเซีย (รอสคอสมอส) ประกาศเมื่อวันอาทิตย์ (20 สิงหาคม) ว่า ศูนย์ปฏิบัติการภาคพื้นดินขาดการติดต่อกับยานลูนา-25 เมื่อเวลา 14.57 น. ของวันเสาร์ (19 สิงหาคม) ตามเวลารัสเซีย และในช่วงวันที่ 19-20 สิงหาคมได้ดำเนินการค้นหาตำแหน่งของยานและพยายามติดต่อสื่อสาร แต่ไม่เป็นผล รวมทั้งผลการวิเคราะห์เบื้องต้น พบว่า ยานเปลี่ยนทิศทางวงโคจรก่อนพุ่งชนดวงจันทร์ แต่ยังไม่ทราบสาเหตุแน่ชัด และคณะกรรมการพิเศษที่จัดตั้งขึ้นจะตรวจสอบหาเหตุผลที่ทำให้สูญเสียยานลูนา-25
การแถลงของรอสคอสมอสมีขึ้นเพียงหนึ่งวันหลังจากยานสำรวจรายงานสถานการณ์ฉุกเฉินขณะพยายามเข้าสู่วงโคจรในระดับที่เตรียมตัวก่อนการลงจอด ส่งผลให้ยานไม่สามารถเข้าสู่วงโคจรได้ตามที่กำหนด ในขณะที่ตามแผนยานจะลงจอดที่ขั้วใต้ของดวงจันทร์ในวันที่ 21 สิงหาคม