โศกนาฎกรรมครั้งนี้เริ่มมาตั้งแต่วันที่ 1 กันยายน 2547 ซึ่งตามธรรมเนียมแล้ว วันนี้เป็นวันที่สถาบันการศึกษาทั่วประเทศจะเปิดการเรียนการสอนเป็นวันแรกของปีการศึกษา
ในวันเปิดภาคเรียนแบบนี้ ทุกโรงเรียนที่เปิดสอนในระดับประถมจะมีความคึกคักมากเป็นพิเศษ เมื่อบรรดาพ่อแม่ผู้ปกครองต่างก็จะมาที่โรงเรียน เพื่อให้กำลังใจกับนักเรียนหน้าใหม่ที่เข้าเรียนในโรงเรียนครั้งแรกในฐานะนักเรียนในระดับชั้นเกรด 1 และที่โรงเรียนหมายเลข 1 เมืองเบสลัน ในเขตการปกครองสาธารณรัฐออสเซเทียเหนือ - อลาเนีย ในแถบเทือกเขาคอเคซัส ก็เช่นเดียวกัน ในวันเช้านั้น มีผู้คนมารวมตัวกันที่โรงเรียนเป็นจำนวนมาก ตามปกติที่นี่จะมีครูประมาณ 60 คน และนักเรีนประมาณ 800 คน
จู่ ๆ ก็ปรากฏว่ามีกลุ่มผู้ก่อการร้ายมุสลิมติดอาวุธ ที่ส่วนมากเป็นชาวอินกุช และเชชเนีย รวม 32 คนปรากฏตัวขึ้นเมื่อเวลา 09.11 น. พวกเขากวาดต้อนทุกคน ทั้งเด็กนักเรียน พ่อแม่ผู้ปกครอง และคณะครูมากกว่า 1,100 คน เข้าไปกักตัวในโรงพละของโรงเรียน คนร้ายเหล่านี้เป็นสมาชิกกลุ่มริยัด อุส ซาลิฮีน ที่ถูกส่งมาโดยชามิล บาซาเยฟ ขุนศึกชาวเชชเนีย เพื่อกดดันให้รัสเซียถอนทหารออกจากเชชเนีย และยอมรับในเอกราชของเชชเนีย ในช่วงเริ่มต้น มีผู้หลบหนีออกมาได้ประมาณ 50 คน และมีการแจ้งเหตุไปที่ตำรวจ ทำให้มีการยิงปะทะกันตั้งแต่วันแรก แต่ปรากฏว่าฝ่ายคนร้ายเป็นฝ่ายที่ยึดโรงเรียนเอาไว้ได้
ในระหว่างที่จับตัวประกัน คนร้ายก็ยังสังหารตัวประกันตายไปหลายสิบคนด้วยอาวุธปืนและระเบิด ขณะที่ทางการก็ส่งเจ้าหน้าที่มาปิดล้อมโรงเรียน แต่ทางการก็ยืนยันจะไม่ใช้กำลังในการบุกเข้าช่วยตัวประกัน ในวันที่ 2 คนร้ายมีการปล่อยตัวประกันออกมาบ้าง แต่ก็ไม่ยอมให้มีการส่งอาหารและน้ำเข้าไปให้ตัวประกัน ในขณะที่สภาพอากาศในช่วงนั้นก็ร้อนจัด จนหลายคนต้องถอดเสื้อออก เรื่องนี้ทำให้เด็กเล็ก ๆ มากมาย มีสภาพร่างกายอ่อนแอเพราะขาดน้ำและอาหาร เมื่อได้รับการช่วยเหลือออกมา