นอกจากนี้ ยังมีความคืบหน้า 4 ส่วนงานสำคัญ คือ 1.เวนคืนที่ดิน โดยขณะนี้ การรถไฟแห่งประเทสไทย หรือ ร.ฟ.ท.ได้ตั้งคณะกรรมการขึ้นมากำหนดราคาค่าทดแทน คาดว่าภายในเดือนพฤศจิกายนนี้ จะลงนามในสัญญาซื้อขาย เวนคืนและจ่ายเงินค่าเวนคืนได้ ส่วนแปลงที่ยังมีปัญหาเจ้าของที่ฟ้องร้องคาดว่าจะเจรจาให้แล้วเสร็จภายในเดือนสิงหาคม 2564
2.พื้นที่บุกรุก ปัจจุบัน ร.ฟ.ท.ได้เร่งผลักดันผู้บุกรุกออกจากพื้นที่แล้ว โดยล่าสุดได้ฟ้องร้องดำเนินคดีจำนวน 562 ราย
3.พื้นที่สัญญาเช่าเดิม ร.ฟ.ท. ได้เร่งยกเลิกสัญญาเช่าที่ดินเดิมรวม 213 ราย แบ่งเป็น ช่วงดอนเมือง-พญาไทย 100 ราย คาดว่าจะยกเลิกสัญญาแล้วเสร็จทั้งหมด ธ.ค.นี้ และช่วง ลาดกระบัง-อู่ตะเภา จำนวน 113 ราย คาดว่าจะยกเลิกสัญญาแล้วเสร็จทั้งหมดเดือนตุลาคม 2563
4.การขยายเขตทางเพิ่มเติมเพราะต้องเปลี่ยนแนวเส้นทาง 6 จุด ซึ่งมีผู้ได้รับผลกระทบ 48 ราย รวม 63 แปลง ขณะนี้เร่งสำรวจและรับความเห็นประชาชนที่ถูกเวนคืนที่ดินและที่อยู่ในพื้นที่ข้างเคียงเพิ่ม คาดว่าจะเสร็จเดือนกรกฎาคมนี้ หลังจากนั้นจะเสนอให้ กพอ.พิจารณา ซึ่งต้องประเมินผลกระทบสิ่งแวดล้อมด้วย
ร.ฟ.ท.ยังมั่นใจว่าจะส่งมอบพื้นที่ส่วนแรกช่วง สุวรรณภูมิ-อู่ตะเภา ให้เอกชนเข้าพื้นที่ก่อสร้างได้ 100% ภายในเดือนกุมภาพันธ์ 2564 ตามแผน และอีกส่วน คือ ช่วงสุวรรณภูมิ-อู่ตะเภา จะส่งมอบพื้นที่ภายใน 2 ปี นับจากวันลงนามสัญญา
สำหรับปัญหาบุกรุกขณะนี้แบ่งเป็น 2 กลุ่ม ที่ต้องรีบเข้าไปดำเนินการ ได้แก่ 1.ช่วงดอนเมืองถึงสุวรรณภูมิ 782 หลัง กระทบโครงการ 197 หลัง 2.ช่วงสุวรรณภูมิ-อู่ตะเภา 570 หลัง กระทบโครงการ 301 หลัง โดยพื้นที่บุกรุกที่กระทบโครงการอยู่ระหว่างดำเนินการฟ้องร้อง พร้อมการเจรจา ซึ่งส่วนใหญ่เป็นชุมชน ดังนั้นทาง ร.ฟ.ท.ต้องพิจารณาจัดหาพื้นที่ใหม่เพื่อรองรับ
ขณะเดียวกัน บริษัท รถไฟความเร็วสูงสายตะวันออกเชื่อมสามสนามบิน จํากัด หรือกลุ่มซีพี ผู้ชนะการประกวดราคาได้รายงานความคืบหน้าการเข้าบริหารรถไฟฟ้าแอร์พอร์ต เรล ลิงค์ โดยที่ผ่านมาเข้าพื้นที่เพื่อตรวจสอบสถานะด้านเทคนิค และเตรียมความพร้อมในการเดินรถ
ปัจจุบันกลุ่มซีพีอยู่ระหว่างตรวจสอบเทคนิคและความพร้อมเดินรถ รวมทั้งปรับปรุงบริการ เช่น รีโนเวทสถานี ติดไฟ ติดแอร์ และพัฒนาลานจอดรถยนต์ เพื่อสร้างจุดเดินทางเชื่อมต่อ โดยตั้งเป้าว่าจะแล้วเสร็จในเดือนกันยายน 2564 ก่อนเปิดให้บริการรถไฟฟ้าแอร์พอร์ต เรล ลิงก์ โฉมใหม่ในวันที่ 24 ตุลาคม 2564
การที่เอกชนจะเข้ามาเดินรถแอร์พอร์ต เรล ลิงค์นั้น มีเงื่อนไขกำหนดในสัญญาด้วยว่า เอกชนจะต้องจ่ายเงินค่าโอนสิทธิรับบริหารให้ ร.ฟ.ท. ก่อนเข้าบริหารเดินรถ วงเงินประมาณ 1.6 หมื่นล้านบาท
นอกจากนี้ เอกชนยังกำหนดกรอบเวลาเปิดให้บริการไฮสปีดเทรนเชื่อม 3 สนามบิน เบื้องต้นในเดือน ม.ค.2569 พร้อมทั้งให้ข้อมูลถึงแผนพัฒนาพื้นที่เชิงพาณิชย์โดยรอบสถานี โดยระบุว่าปัจจุบันอยู่ระหว่างจัดทำแผนพัฒนาในส่วนของสถานีช่วงสุวรรณภูมิ-ตะเภา