โครงการนี้ถูกตั้งคำถามถึงความไม่โปร่งใส เพราะมีข่าวฉาวเอื้อประโยชน์ให้บริษัทเอกชน และแก้แบบช่วยเหลือกันกว่า 100 ครั้ง หมดงบไปกว่า 1,200 ล้านบาท รัฐมนตรีว่าการกระทรวงศึกษาธิการ ต้องดึงเรื่องมาดูเอง และสั่งตั้งคณะกรรมการตรวจสอบข้อเท็จจริง โดยมีปลัดกระทรวงศึกษาฯเป็นประธาน ผลสรุปเบื้องต้นออกมาแล้วว่ามีมูลทุจริต ต้องตั้งกรรมการสอบวินัยร้ายแรงอดีตข้าราชการระดับ 11 กระทรวงศึกษาฯ และข้าราชการระดับสูงทั้งในและนอกราชการอีกนับสิบคน ขณะนี้กำลังรอ "นายกฯลุงตู่" ลงนามในคำสั่งย้ายออกจากตำแหน่ง พร้อมตั้งคณะกรรมการสอบสวนทางวินัย
ล่าสุดวันนี้ เลขาธิการคณะกรรมการการอาชีวศึกษา หรือ กอศ. หน่วยงานเจ้าของโครงการ ได้พาคณะสื่อมวลชนลงพื้นที่ไปดูความคืบหน้าของโครงการ ซึ่ง "ล่าความจริง" ก็ส่งทีมข่าวตามลงไปด้วย โดยเลขาธิการ กอศ. ได้เข้าประชุมกับผู้ว่าราชการจังหวัดสงขลา ในฐานะคณะทำงานระดับจังหวัด ในคณะกรรมการบริหารจัดการโครงการปรับปรุงการก่อสร้างอควาเรียมสงขลา ที่รัฐมนตรีศึกษาฯตั้งขึ้นมาเพื่อเดินหน้าโครงการให้แล้วเสร็จภายหลังการประชุม ผู้ว่าฯสงขลา คุณทรงพล สวาสดิ์ธรรม บอกว่า การก่อสร้างส่วนที่ยังไม่แล้วเสร็จ เหลือประมาณ 20% ส่วนใหญ่เป็นเรื่องระบบสาธารณูปโภค และระบบบริหารจัดการ ขณะที่โครงสร้างของอาคารได้ดำเนินการเสร็จเกือบทั้งหมดแล้ว การประชุมวันนี้เป็นการวางกรอบการขับเคลื่อนงานก่อสร้าง / มีการกำหนดกรอบเวลาไว้ประมาณ 45 วัน (หมายความว่า 45 วันนับจากปีงบประมาณใหม่ คือ 1 ตุลาฯ ก็ต้องสรุปแผนเพื่อเสนองบไม่เกินกลางเดือนพฤศจิกายน) ซึ่งก็ต้องเสนอของบประมาณอีกก้อนเพื่อก่อสร้างให้เสร็จสิ้น / พร้อมทั้งต้องเชิญผู้เชี่ยวชาญด้านต่างมาร่วมในคณะทำงาน ทั้งวิศวกรเครื่องกล วิศวกรไฟฟ้า รวมถึงผู้เชี่ยวชาญด้านน้ำประปา โดยภายในสัปดาห์หน้าจะมีการลงพื้นที่ตรวจสอบรายละเอียดต่างๆ ทันที เพื่อเสนอแผนดำเนินงานต่อไป
นอกจากนี้ ยังมีแนวทางว่าจะเชิญผู้แทนกระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมมาร่วมเป็นเจ้าภาพในการดูแลอควาเรียมฯด้วย
สำหรับวงเงินงบประมาณที่จะขอเพิ่มสำหรับใช้ก่อสร้างต่อให้เสร็จนั้น เลขาธิการคณะกรรมการการอาชีวศึกษา คุณสุเทพ ชิตยวงษ์ บอกว่า ยังไม่สามารถระบุตัวเลขได้ แต่รัฐมนตรีศึกษากำชับมาว่า จะต้องดำเนินการทุกขั้นตอนเพื่อกำหนดงบประมาณก่อสร้างส่วนที่ยังเหลือให้เสร็จ ภายในเดือนพฤศจิกายน แต่ก็ไม่รับประกันว่าโครงการจะเสร็จสมบูรณ์ทันในรัฐบาลชุดนี้หรือไม่ แต่ทุกฝ่ายจะพยายามให้เร็วที่สุด