สำหรับ "คดีเงินทอนวัด" ตำรวจ ปปป.ได้ทำสำนวนการสอบสวนในเบื้องต้นมาแล้ว 2 เฟส โดยเฟสแรกมีวัดเป้าหมายจำนวน 26 วัด พบความผิด 12 วัด มีเงินโอนเข้าบัญชีวัด 95 ล้านบาท เงินจำนวนนี้ถูกเจ้าหน้าที่สำนักพุทธฯและเครือข่ายเรียกคืนเป็นเงินทอน จำนวน 60 กว่าล้านบาท คิดเป็น 63.54%
ส่วนคดีเงินทอนวัดเฟส 2 ตรวจสอบวัดเป้าหมาย จำนวน 47 วัด พบความผิด 23 วัด งบประมาณ 188 ล้านบาท เรียกคืนเงินทอน 141 ล้านบาท คิดเป็นสัดส่วนเงินทอนสูงถึง 74% โดยคดีเงินทอนวัดเฟส 2 มีผู้ต้องหา 19 คน ในจำนวนนี้มีพระสงฆ์ 4 รูป เป็นระดับเจ้าคณะเกือบทั้งสิ้น ที่ผ่านมาคณะกรรมการ ป.ป.ช.ได้ตั้งอนุกรรมการไต่สวน และชี้มูลความผิดผู้ที่เกี่ยวข้องไปบางส่วนแล้ว รวมทั้งอดีตผู้บริหารระดับสูงของสำนักพุทธฯด้วย
สำหรับการดำเนินคดีกับพระชั้นผู้ใหญ่ที่เกี่ยวข้องกับการทุจริต ครั้งนี้ไม่ใช่ครั้งแรก แต่ก่อนหน้านี้มีการจับกุม นายสมเกียรติ ขันทอง อายุ 53 ปี หรือ อดีตพระครูกิตติ พัชรคุณ เจ้าคณะอำเภอชนแดน จังหวัดเพชรบูรณ์ มาแล้ว และถูกจับสึกเพราะศาลไม่อนุญาตให้ประกันตัว