ปาเกียวออกมาตำหนิคนกลุ่มนี้ เนื่องจากไม่เห็นด้วยกับข้อเสนอให้คนกลุ่มรักร่วมเพศ สามารถแต่งงานกันได้
แต่ล่าสุด ในทวิตเตอร์ของตัวเอง ปาเกียวบอกว่า " ผมเสียใจที่ทำให้ผู้คนต้องเจ็บปวด โดยการเปรียบเทียบพวกรักร่วมเพศกับพวกสัตว์ กรุณายกโทษให้ผมด้วยสำหรับการที่ผมทำให้คนเหล่านั้นต้องเจ็บปวด ขอให้พระเจ้าคุ้มครอง
การออกมาขอโทษมีขึ้นหลังจากที่มีการโจมตีเขากันอย่างมากมายตามหน้าสื่อสังคมออนไลน์ จากสิ่งที่เขากล่าวโจมตีกลุ่มคนรักร่วมเพศ
ปาเกียว ซึ่งมีตำแหน่งทางการเมืองเป็นถึงวุฒิสมาชิกจากการเลือกตั้งเมื่อเดือนพฤษ ภาคมปีที่แล้ว ชี้แจงว่า เขาไม่ได้ประณามใคร แต่เพียงแค่พูดความจริงของสิ่งที่พระคัมภีร์ไบเบิ้ลได้ว่าเอาไว้เท่านั้น
ในวีดีโอที่โพสต์ในเว็บไซต์ด้านการเลือกตั้งของสถานีโทรทัศน์แห่งหนึ่ง ปาเกียวบอกว่า สัตว์นั้นดีกว่า เพราะว่าพวกมันสามารถแยกแยะระหว่างเพศชายและเพศหญิงได้ ถ้าผู้ชายจับคู่กับผู้ชาย และผู้หญิงจับคู่กับผู้หญิง พวกเขาเหล่านี้ก็แย่ยิ่งกว่าสัตว์
ชาวฟิลิปปินส์ต่างก็ไม่พอใจและตกตะลึงกับคำพูดของปาเกียว บางคนบอกว่า ปาเกียวเป็นนักมวยที่ยิ่งใหญ่ แต่ทัศนคติของเขาในเรื่องความเท่าเทียมกันในทางเพศ เป็นเรื่องที่ล้าสมัยมากๆ บางคนก็บอกว่า ไม่ควรปล่อยให้ปาเกียวมีที่นั่งในวุฒิสภา
หลังเขาได้ออกมาขอโทษ ก็ปรากฏว่ายังไม่ได้มีกระแสตอบรับในทางที่ดีในทันที เมื่อประชาชนยังคงออกมาวิจารณ์เขาตามสื่อออนไลน์ต่อไป