นับตั้งแต่ศาลปกครองสูงสุดพิพากษาให้กรมควบคุมมลพิษแพ้คดีคลองด่านเมื่อวันที่ 21 พฤศจิกายน2557 ที่ผ่านมา เนื่องจากกระบวนการแต่งตั้งคณะอนุญาโตตุลาการชอบด้วยกฎหมายแล้ว และคำวินิจฉัยของคณะอนุญาโตตุลาการไม่ขัดต่อความสงบเรียบร้อยและศีลธรรมอันดีของประชาชน สัญญาว่าจ้างไม่เป็นโมฆะตามที่กรมควบคุมมลพิษกล่าวอ้าง ทำให้ต้องเร่งหาแนวทางเจรจากับผู้ประกอบการเพื่อขอลดทอนการจ่ายค่าเสียหายให้ลดลงมากที่สุด
สำหรับมูลค่าความเสียหายจากคดีคลองด่าน แบ่งเป็น เงินต้นใช้ในการฟ้องร้องคดีกว่า 5,270 ล้านบาท , ดอกเบี้ยจ่ายจากเงินต้นทั้งหมดตั้งแต่วันที่กรมควบคุมมลพิษยกเลิกสัญญาตั้งแต่วันที่ 28 กุมภาพันธ์ 2546 เป็นต้นมารวม 11 ปี ในอัตราร้อยละ 7.5 ต่อปี คิดเป็นเงินประมาณ 4,348 ล้านบาท นับเป็นมูลค่าความเสียหายทั้งหมดประมาณ 9,618 ล้านบาท ซึ่ง คพ.จ่ายเงินค่าก่อสร้างไปแล้วกว่า 21,023 ล้านบาท หรือ ร้อยละ 90 เมื่อรวมมูลค่าความเสียหายทั้งโครงการสูงกว่า 30,642 ล้านบาท ยังไม่นับรวมด้านการเสียโอกาสที่ล่าช้ามากว่า 10 ปี และค่าซ่อมแซมให้ใช้งานได้
ขณะนี้กรมควบคุมมลพิษอยู่ระหว่างรวบรวมตัวเลขความเสียหายที่ชัดเจนทั้งหมดกับหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง จากนั้นสรุปตัวเลขความเสียหายชัดเจนให้รัฐมนตรีว่าการกระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม เพื่อรายงานนายกรัฐมนตรีและคณะรัฐมนตรีรับทราบต่อไป เพื่อขอให้พิจารณาอนุมัติงบกลางฯมาชำระเงินให้ผู้ประกอบการตามคำสั่งศาลปกครองสูงสุดต่อไป