คลิปวิดีโอจากวิทยาลัยการบินพลเรือน ที่ใช้สนามบินมิยาซากิเป็นสนามฝึกนักบิน สามารถบันทึกไว้ได้ในช่วงกลุ่มฝุ่นสีดำพวยพุ่งขึ้นจากพื้นเพียง 2 นาที หลังเครื่องบินผ่านจุดเกิดเหตุในช่วงเช้าวันพุธ (2 ตุลาคม)
กระทรวงคมนาคม เปิดเผยว่า เจ้าหน้าที่พบหลุมระเบิดขนาดเส้นผ่านศูนย์กลาง 7 เมตร และลึก 1 เมตร บนแท็กซีเวย์ หลังเกิดการระเบิดในเวลาราว 8.00 น. ตามเวลาท้องถิ่น และหน่วยเก็บกู้วัตถุระเบิดของกองกำลังป้องกันตนเองได้เข้าตรวจสอบพื้นที่เกิดเหตุ
เที่ยวบินขาเข้าและออกทั้งหมดถูกระงับตั้งแต่เวลา 9.00 น. และสนามบินประกาศว่าจะกลับมาให้บริการตามปกติในเช้าวันพฤหัสบดี หลังซ่อมแซมจุดที่เกิดหลุมขนาดใหญ่
ต่อมาโฆษกรัฐบาล แถลงว่า ระเบิดที่ผลิตโดยสหรัฐฯ เป็นสาเหตุของการระเบิดบนแท็กซีเวย์ และรันเวย์ต้องปิดใช้งาน ส่งผลให้เที่ยวบิน 87 เที่ยวถูกยกเลิก
ทีมเก็บกู้ระเบิดยืนยันว่า ระเบิดน้ำหนัก 500 ปอนด์ของสหรัฐฯ เป็นสาเหตุของการระเบิด และรัฐมนตรีคมนาคม บอกว่า ยังไม่อาจยืนยันได้ว่า ระเบิดลูกนี้ถูกทิ้งไว้เมื่อใด แม้สื่อท้องถิ่นรายงานว่า อาจเป็นระเบิดที่สหรัฐฯ ทิ้งไว้สมัยสงครามโลกครั้งที่ 2
สนามบินแห่งนี้เคยเป็นฐานทัพอากาศเก่าของกองทัพเรือ และมักพบระเบิดของสหรัฐฯ ที่ยังไม่ระเบิดหลงเหลือมาจากสมัยสงครามโลกครั้งที่ 2 โดยพบระเบิดที่ยังไม่ระเบิด 2 ลูก ที่สนามบินในปี 2554 และอีก 1 ลูก ในปี 2564