ประชาชนที่ได้รับผลกระทบจากเส้นทางพายุพัดผ่านและยังจำเป็นต้องอาศัยภายในศูนย์พักพิงชั่วคราวมีจำนวนประมาณ 4,600 คน ขณะที่นาข้าวในภาคเหนือส่วนใหญ่ได้รับความเสียหายเพราะถูกน้ำท่วม อีกทั้งภัยพิบัติครั้งนี้ ยังส่งผลให้เขื่อนในพื้นที่ต่างๆ 130 แห่งพังทลายลงมา
ด้านนายกรัฐมนตรี ชินโซ อาเบะ ของประเทศญี่ปุ่น ระบุว่า ทางการได้ประกาศให้ไต้ฝุ่นฮากิบิสเป็นภัยพิบัติที่สร้างความเสียหายร้ายแรงเพื่อจัดสรรงบประมาณพิเศษสำหรับการฟื้นฟูพื้นที่ต่างๆที่ได้รับผลกระทบ
ส่วนนายทาโร อาโสะ รัฐมนตรีว่าการกระทรวงการคลังของประเทศญี่ปุ่น เผยว่า มีงบประมาณสำรองเพื่อฟื้นฟูภัยพิบัติอยู่ 500,000 ล้านเยน (ราว 140,500 ล้านบาท) และพร้อมพิจารณาเพิ่มเติมหากจำเป็น
นอกจากนี้ การฟื้นฟูพื้นที่ประสบภัยพิบัติทำให้ทางการญี่ปุ่นแถลงเลื่อนพระราชพิธีริ้วกระบวนรถยนต์พระที่นั่งของ สมเด็จพระจักรพรรดินารุฮิโตะ และ สมเด็จพระจักรพรรดินีมาซาโกะ พระมเหสี ซึ่งจะเสด็จพระราชดำเนินไปตามถนนในกรุงโตเกียวเพื่อทักทายพสกนิกร เนื่องในวาระเฉลิมฉลองพระราชพิธีบรมราชาภิเษกในวันที่ 22 ตุลาคม ออกไปเป็นวันที่ 10 พฤศจิกายน แทน