11.ธนาคารเพื่อการเกษตรและสหกรณ์การเกษตร สาขาบันนังสตา 12.ธนาคารกรุงไทย สาขาบันนังสตา 13.ธนาคารออมสิน สาขายะหา 14.ธนาคารเพื่อการเกษตรและสหกรณ์การเกษตร สาขายะหา 15.ธนาคารเพื่อการเกษตรและสหกรณ์การเกษตร สาขารามัน 16.ธนาคารกรุงไทย สาขารามัน
และที่ อ.เบตง 6 แห่ง ได้แก่1.ธนาคารเพื่อการเกษตรและสหกรณ์การเกษตร 2.ธนาคารกสิกรไทย 3.ธนาคารกรุงไทย 4.ธนาคารนครหลวงไทย 5.ธนาคารออมสิน และ 6.ธนาคารกรุงเทพ
หลังควบคุมสถานการณ์ได้ เจ้าหน้าที่ได้กระจายกำลังเข้าตรวจสอบที่เกิดเหตุ และโทรทัศน์วงจรปิดของธนาคารทุกแห่ง ส่วนใหญ่พบว่า คนร้ายใช้ระเบิดชนิดแสวงเครื่อง จุดชนวนด้วยโทรศัพท์มือถือ คนร้ายส่วนใหญ่แต่งกายชุดนักศึกษาช่างทั้งหญิงและชาย เข้าไปยังธนาคาร โดยนำวัตถุระเบิดบรรจุใส่ไว้ในแฟ้มเอกสาร หนังสือ ถุงพลาสติก กระจายวางไว้ที่ชั้นวางหนังสือพิมพ์ หน้าเคาน์เตอร์ฝากถอนเงิน และเคาน์เตอร์เขียนใบนำฝาก-ถอนเงิน ภายในธนาคาร จากนั้นได้จุดระเบิดพร้อมกัน แรงระเบิดทำให้ภายในธนาคารได้รับความเสียหายทุกแห่ง หลังเกิดเหตุธนาคารทุกแห่งในเขตเทศบาลนครยะลา และเทศบาลเมืองเบตง ประกาศปิดทำการทันที
มีการวิเคราะห์กันว่า การที่กลุ่มคนร้ายเลือกลงมือในวันที่ 31 ส.ค. 2549 โดยมุ่งโจมตีธนาคารที่ตั้งเฉพาะในพื้นที่ จ.ยะลา ก็เพราะวันที่ 31 ส.ค. เป็นวันก่อตั้งขบวนการเบอร์ซาตูซึ่งเป็นวันที่ประกาศเจตนารมณ์ของแกนนำ ขบวนการโจรก่อการร้าย ( ขจก.) โดยกลุ่มพันธมิตรเบอร์ซาตู ประกอบด้วย พูโลใหม่,บีอาร์เอ็น คองเกรส,บีไอพีพี,มูจาฮีดีน ปัตตานี และการก่อเหตุุทุกครั้งที่เป็นเหตุการณ์ใหญ่ๆ มักจะตรงกับวันที่มีความสำคัญของขบวนการ เช่น วันที่เกิดเหตุคนร้ายยึดมัสยิดกรือเซะ เมื่อ 28 เมษายน ปี 2547 ก็ตรงกับวันที่จอมพล ป.พิบูลสงคราม นายกรัฐมนตรี(ในขณะนั้น) ส่งกองกำลังเข้าปราบปรามผู้ก่อการที่ ต.ดุซงญอ อ.ระแงะ จ.นราธิวาส เมื่อ 28 เมษายน ปี 2491 โดยมีการเรียกเหตุการณ์ครั้งนั้นว่า กบฏดุซงญอ