เพื่อนำประเทศกลับสู่ภาวะปกติ และสร้างความสามัคคีให้กลับมาโดยเร็ว คือเหตุผลของการทำรัฐประหาร ที่อดีตผู้บัญชาการทหารบก พลเอก สนธิ บุญยรัตกลิน แถลง ในคืนวันที่ 19 กันยายน 2549
แต่ความวุ่นวายทางการเมืองหลังจากรัฐประหาร 19 กันยาฯ ดูเหมือนสวนทางกับเป้าหมายของ คมช. เพราะความขัดแย้งไม่เคยหายไป แกนนำ พันธมิตร และ นปช. เห็นตรงกันว่า การรัฐประหารครั้งนั้น ไม่ได้แก้ไขความขัดแย้งที่แท้จริง มิหนำซ้ำ ยังทำให้เหตุการณ์ยืดเยื้อและบานปลาย
รายงานปรองดองของ คอป. ที่มีนายคณิต ณ นคร เป็นประธาน อธิบายถึงรัฐประหารปี 2549 ว่า นอกจากไม่ได้แก้ปัญหาทางการเมือง ยังเป็นเงื่อนไข ที่ทำให้ความขัดแย้งขยายตัว ซับซ้อน และกลายเป็นบาดแผลทางการเมืองที่ร้าวลึก
10 ปี หลังจากรัฐประหาร 19 กันยา การเมืองมีนายกรัฐมนตรี 6 คน มีความวุ่นวายทางการเมือง ที่มีคนบาดเจ็บล้มตายจำนวนมาก สถาบันการเมืองเริ่มไม่ตอบโจทย์ความขัดแย้ง
นักสันติวิธี ตั้งคำถามว่า การทำรัฐประหารทำให้การเมืองไทยเข้มแข็งมากขึ้น หรือเหนื่อยล้าลงกว่าเดิม