สหพันธ์ฟุตบอลแห่งเอเชีย เตรียมใช้เกณฑ์การแบ่งทีมวาง ในการจับสลากแบ่งสายของการแข่งขันฟุตบอล เอเอฟซี ยู23 แชมเปี้ยนชิพ 2016 รอบสุดท้ายที่ประเทศกาตาร์ โดยยึดจากผลงานการแข่งขันในครั้งที่ผ่านมา ที่ใช้ชื่อว่า เอเอฟซี ยู22 แชมเปี้ยนชิพ 2013 ที่ประเทศโอมานเป็นเจ้าภาพ ซึ่งเกณฑ์ดังกล่าวถือเป็นเกณฑ์ที่เอเอฟซี ใช้กับการแข่งขันในระดับรุ่นอายุ 16 ปี, 19 ปี และ 22 ปี มาโดยตลอด
สำหรับการแข่งขันฟุตบอล เอเอฟซี ยู23 แชมเปี้ยนชิพ 2016 รอบสุดท้ายที่ประเทศกาตาร์ ระหว่างวันที่ 12-30 มกราคม 2559 ได้มีการจัดโถของทีมที่เข้าร่วมแข่งขันแบ่งเป็น 4 โถ ก่อนจับสลากแบ่งกลุ่ม ผลปรากฎดังต่อไปนี้ โถ 1 : กาตาร์ (เจ้าภาพ), อิรัก, ซาอุดิอาระเบีย, จอร์แดน โถ 2 : เกาหลีใต้, ออสเตรเลีย, ญี่ปุ่น , สหรัฐอาหรับเอมิเรตส์ โถ 3 : ซีเรีย, อิหร่าน, เกาหลีเหนือ, อุซเบกิสถาน โถ 4 : จีน, เยเมน, ไทย, เวียดนาม สำหรับการแข่งขันฟุตบอลรายการนี้ ตำแหน่งแชมป์ ,รองแชมป์ และ ทีมอันดับที่ 3 จะได้โควต้าไปเล่นในฟุตบอลโอลิมปิกเกมส์ 2016 ที่กรุงริโอ เดอ จาเนโร ประเทศบราซิล ต่อไป