ปัจจุบันหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง ได้สร้างนั่งร้านขึ้นไปบูรณะปล้องไฉนใต้ปลียอดทองคำหลังจากพบคราบสนิมไหลเยิ้มออกมาเมื่อปี 2556 เกิดความชำรุดเสียหายสร้างความไม่สบายใจให้แก่ชาวพุทธเป็นอย่างมาก
จนมีการตั้งข้อสังเกตต่าง ๆ นานา ถึงความไม่โปร่งใส่ในการบูรณะเมื่อครั้งที่แล้ว ๆ มา อีกทั้งเกิดความกังวลว่าจะหลุดจากการขึ้นทะเบียนเป็นมรดกโลกทางวัฒนธรรม
อนึ่งวัดพระมหาธาตุวรมหาวิหารแห่งนี้ เป็นวัดเก่าแก่ที่สร้างมานานนับพันปี ประชาชนผู้เลื่อมใสศรัทธาในพระพุทธศาสนาตั้งแต่ครั้งโบราณจนถึงปัจจุบัน จะนำของมีค่าเช่น ทองคำ เพชรนิลจินดาและเครื่องประดับอื่น ๆ จำนวนมากไม่สามารถประเมินค่าได้มาบูชาพระธาตุ
โดยเฉพาะปลียอดจะหุ้มด้วยทองคำน้ำหนักประมาณ 216 กิโลกรัมเหลืองอร่ามโดดเด่นเห็นแต่ไกลชาวใต้โดยทั่วไปจึงมักเรียกพระบรมธาตุเจดีย์ แห่งนี้ว่า " พระธาตุยอดทอง"