การป้องกันกำจัดวัชพืชด้วยวิธีผสมผสาน มี 4 วิธี ได้แก่ วิธีกล คือการใช้แรงงานคน สัตว์ เครื่องทุ่นแรง วัสดุคลุมดิน หรือการเผาทำลายวัชพืช วิธีเขตกรรม คือ การลดปัญหาวัชพืชเติบโตแย่งอาหารพืชที่ต้องการปลูก โดยใช้เมล็ดพันธุ์พืชที่ปลูกให้สูงกว่าปกติ จัดการปุ๋ยให้ถูกต้องเหมาะสมหรือปลูกพืชหมุนเวียน สำหรับชีววิธีก็ได้แก่การใช้แมลง สัตว์ หรือโรคพืชมาช่วยป้องกันกำจัดวัชพืช
ส่วนการใช้สารอารักขาพืชนั้นควรศึกษาวิธีการใช้ให้ละเอียดถูกต้อง เพื่อจะได้ไม่เป็นอันตรายต่อผู้ใช้และไม่ทำลายสิ่งแวดล้อม อย่างไรก็ตามเกษตรกรควรเลือกป้องกันกำจัดวัชพืชด้วยวิธีผสมผสานในวิธีที่เหมาะกับการทำเกษตรของตน แต่ควรเลือกใช้สารอารักขาพืชเป็นวิธีสุดท้าย